2005年11月13日中石油吉林石化公司双苯厂发生爆炸事故后，事故区域排出的污水进入松花江，事故产生的主要污染物苯、苯胺和硝基苯等有机物严重超标，致使位于松花江下游的哈尔滨市停水4天，造成重大环境污染事件。
    在紧急应对这次重大环境污染事件过程中，中国科学院东北地理与农业生态研究所积极配合地方部门，在第一时间内提供了水体中硝基苯等有机物的监测和研究数据，并在有关部门向国务院总理温家宝汇报中得到了应用。相关的研究正在进一步进行中，主要对松花江污染段水体横断面及底泥中硝基苯的分布状况、水体结冰过程水和冰中硝基苯分布、解冻时冰块中硝基苯的释放情况进行研究，为探明此次重大环境污染事件的后续影响做出预测。
    在此次重大环境污染事件中能够及时、准确地在第一时间内提供大量监测和研究数据，与东北地理所在知识创新工程试点工作中十分重视能力建设是分不开的。进入知识创新工程序列后，配备了QP－5050A型高分辨气相色谱/质谱联用仪、GC－2010型气相色谱仪、Waters－600E型高效液相色谱仪等大型仪器，大幅度提升了研究所技术支撑系统的综合创新能力，同时也提升了对社会需求服务的能力。进入知识创新工程序列后，在保证本所科研工作分析测试要求的同时，为社会提供大量的有偿服务。服务对象涵盖东北及周边地区的数十家单位，体现了中科院研究机构的社会服务功能。